順勢療法與一般西醫的差異
最主要的差異是藥劑的選擇方式：
一般的西醫在藥劑上的選擇是根據診斷結果（病名）。所以罹患同一種病的所有病患，都會被施予相同的藥物。例如，當一個病患被西醫診斷罹患肺炎時，他就會像其他的肺炎病患一樣被施予抗生素，這是因為肺炎乃是由細菌引起的。
順勢療法並不是以病名來決定治療的藥物，而是依據病患所表現出來的個別症狀來決定該施予何種順勢藥物。也就是說，就算兩個人得到相同的疾病，順勢醫生有可能因為病患所表現出來的不同症狀而給予不同的順勢藥物。順勢藥物是依據相似的規則來選擇，就如同前面所提到，若將某種順勢藥物讓健康人體服用後，會產生和病患相似的症狀，那麼這種順勢藥物就可以幫助這個病患恢復健康。
舉例來說，當你在廚房切洋蔥時，你會因洋蔥的刺激而不停的流鼻水、掉眼淚，這就是洋蔥（順勢藥物）在健康人體實驗上所引起的症狀。所以當你因一般感冒或過敏產生類似的症狀時，順勢醫生就會給你順勢藥物－ Allium cepa 來進行治療。但 Allium cepa 並不適合用於全部流鼻水症狀的疾病，它只適合治療那些產生類似切洋蔥流鼻水症狀的疾病。如果你的鼻涕是帶血的、黃色的、綠色的或黏稠的，就沒有辦法用Allium cepa來治療，因為它只適合用於像切洋蔥時所產生流鼻水症狀的疾病。
又例如，在深夜裡來一杯香醇可口的咖啡，可以讓你的思慮清晰，趕走瞌睡蟲，讓你精神振奮。這就是咖啡這個藥物在健康人體上所產生的反應。如果你正因為在深夜時，思慮太多、精神振奮而導致的失眠症所苦惱的話，那麼順勢藥物－ Coffea 就可以幫助你一夜好眠。相同的，Coffea 並不適用於所有的失眠症，它只適合用於那些類似因喝太多咖啡導致太振奮，而睡不著的失眠症患者。
我們由以下的例子來進一步說明，依據症狀來治療的順勢療法，和一般西醫依據病名來進行治療的不同之處：如果你有發燒、咳嗽和咳痰等罹患肺炎的症狀，一般西醫會依據這些症狀再加上X光片的檢查，開抗生素給你服用，而所有罹患肺炎的患者都會用抗生素進行治療。但對順勢療法來說，以上的症狀還不夠讓一個順勢醫生選擇正確的順勢藥物。順勢療法需要一些更仔細的症狀說明，如在溫暖的房間會使咳嗽惡化，發燒時會感到口渴，早上十點鐘的時候會覺得冷。尤其是哪些特殊情況時，會導致症狀的加劇或緩和，這些訊息對順勢藥物的選擇是非常重要的。病患對於本身症狀的觀察與說明越詳細，可以幫助順勢醫生越容易找到最適合該病患的順勢藥物。例如，在溫暖的房間中咳嗽會變嚴重，在溫暖的環境中耳朵的疼痛會減輕，以左邊側躺的方式可以讓背痛減緩……等，都是很清楚的症狀描述例子。（請參閱問診內容）
再來，第二個差異是藥物的來源：
順勢藥物的製造方式和一般的西藥完全不同。所有順勢藥物的來源，約有80%來自於天然植物，15%來自於天然礦物，5%來自於一般動物，因為順勢藥物是經過多次高倍率的稀釋後，所得到的產物，所以順勢藥物完全沒有一般西藥的副作用。（請參閱藥力強度）